生理学。ホルモンや神経伝達物質のような細胞内のファーストメッセンジャに反応して生成される細胞内メディエータ。ホルモンは、標的細胞には入らず、細胞表面の膜受容体に結合して細胞内の別の分子の産生に間接的に作用する。これが、細胞内で標的酵素または細胞内受容体へと拡散し、反応が起こる。セカンドメッセンジャは、代謝、分泌、収縮、細胞増殖のような細胞プロセスにおけるシグナルを仲介する。例えば、環状アデノシン一リン酸(サイクリックAMP)、環状グアノシン一リン酸(サイクリックGMP)、IP3、ジアシルグリセロールなどがある。
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